肉雞球蟲病控制的一個核心問題是免疫力問題。這個問題對獸醫門診尤為重要。很多雞場發生球蟲病用藥后好轉，停藥復發。
   
　　這說明雞場中球蟲對所用藥物敏感，用藥時只有一部分雞感染較為嚴重，停藥后這部分雞可能產生一定的免疫力，但剩下的雞在停藥后會接著感染球蟲而成為新的發病者，如此重復，直到所有雞都具備了免疫力。
   
　　在飼料中藥物較為敏感的情況下，免疫力的產生會推遲，所以有的雞群在使用不含抗球蟲藥的飼料時會出現球蟲病。在缺乏有效的預防藥物的情況下，免疫力的產生成為對付球蟲病的主要手段。
   
　　實際上，在飼料中藥物敏感性不高的前提下，大部分雞舍中糞便卵囊數量在4～5周達到高峰，這代表雞群中大部分雞受到感染，雞群在5周齡后就會產生較強的免疫力，對球蟲感染的敏感性下降，雞群不再表現嚴重的球蟲病癥狀。
   
　　雞與球蟲的關系，如同古代戰爭中攻與守的關系，藥物如同城墻，球蟲憑借抗藥性跨越城墻，免疫力如同守城的戰士，強有力的戰士可以擊敗攻上城墻的敵人。
   
　　如果肉雞沒有產生免疫力，在任何時候都有可能出現球蟲病，而且發病越晚危害越大，所以免疫力的產生越早越好。要使雞群較早產生針對各種球蟲的免疫力，使用球蟲疫苗是一種最佳選擇，實際上也是惟一的選擇。
   
　　使用球蟲疫苗后，2～3周就可以產生針對各種球蟲的免疫力，比自然感染產生免疫力的時間大大提前，可以對雞群提供更好的保護作用。