雞孵化期胚胎死因主要有：1.孵化前期死亡（1~6天）：種雞的營養水平及健康狀況不良，主要缺乏維生素A、維生素B；種蛋儲存時間過長；保存溫度過高或過低；種蛋熏蒸消毒過度；孵化前期溫度過高或過低；種蛋運輸時受劇烈振動。2.中期死亡（7~12天）：種雞的營養水平及健康狀況不良，主要缺乏維生素D、維生素B2；入孵前種蛋未預熱；污蛋未消毒或消毒效果差；孵化溫度過高或過低；未翻蛋或翻蛋不當；通風不良。3.后期死亡（13~18天）：種雞的營養水平差，如缺維生素B12；氣室小，濕度過高；胚胎如有明顯充血現象，說明有一段時間高溫；發育極度衰弱表明溫度過低；小頭啄殼是通風換氣不良或小頭向上入孵。4.悶死在殼內：出雛時溫度、濕度過高，通風不良；孵化后期溫度低；胚胎軟骨畸形，胎位異常。5.啄殼后死亡：種雞營養不良；種雞群感染疾??；如果蛋殼洞口有黏液，是由于高溫、高濕；第20~21天通風不良或二氧化碳含量過高；移盤時溫度驟降；小頭向上孵化；1~14天未翻蛋；20~21天孵化溫度過高，濕度過低；在胚胎利用蛋白時遇到高溫，使蛋白未吸收完，尿囊合攏不良，蛋黃未吸收等因素。