一、流行病學調查：著重調查疾病的發生情況，如發病季節、病死率、主要臨床表現及既往病史等；飼養管理方式，如日糧配合及組成、飼料的種類及質量、飼料添加劑的種類及數量、飼養方法及程序等；環境狀況，如土壤類型、水源資料及有無環境污染等。
　　二、臨床檢查：應全面系統，并對所搜集到的癥狀，參照流行病學資料，進行綜合分析。根據臨床表現有時可大致推斷營養代謝病的可能病因，如家禽的不明原因的跛行、骨骼異常，可能是鈣、磷代謝障礙病。
　　三、治療性診斷：為驗證依據流行病學和臨床檢查結果建立的初步診斷或疑問診斷，可進行治療性診斷，即補充某一種或幾種可能缺乏的營養物質，觀察其對疾病的治療作用和預防效果。治療性診斷可作為營養代謝病的主要臨床診斷手段和依據。
　　四、病理學檢查：有些營養代謝病可呈現特征性的病理學改變，如關節型痛風時關節腔內有尿酸鹽結晶沉積；其維生素A缺乏時禽的上部消化道和呼吸道粘膜角化不全等。
　　五、實驗室檢查：主要測定患病個體及發病禽群血液、羽毛及組織器官等樣品中某種（些）營養物質及相關酶、代謝產物的含量，作為早期診斷和確定診斷的依據。
　　六、飼料分析：飼料中營養成分的分析，提供各營養成分的水平及比例等方面的資料，可作為營養代謝病，特別是營養缺乏病病因學診斷的直接證據。